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Cytel.East.v5.0 1CD(醫學臨床實驗設計系統)
CYTEL EAST5 醫學臨床實驗設計系統.更好的計劃,當今最複雜的實驗與臨床實驗設計,類比和分析工具
成功的臨床結果,首先是正確的實驗設計。隨著更多自適應,組序列和固定樣本規模臨床實驗的設計,比
其他任何商業套裝軟體,CYTEL EAST 5提供了許多新的特點,更好地指導審判規劃者通過各種各樣的設計
方案。
FieldTemplater v2.0.1 1CD產生最準確的領域藥效結構
已知的活躍的配體的一些2D結構研究,FieldTemplater產生一系列的構象,配體可能在生理條件採取。分析了這些構象來找到集顯示高分子場
相似(因此也有類似的形狀/綁定屬性)。所有的配體和一個共同的活動一致,很有可能這是生物活性構象。集合內的異同集提供活躍的配體如
何結合常見的活性部位。
FieldAlign v1.0.2 1CD 3d結構活性關係(SAR)工具
FieldAlign是一個強大的設計,3d結構活性關係(SAR)工具,用於計算和藥用化學家,它哪裡的顯示活性化合物是類似的和它們是如何不同。考
慮到3 d結構的積極分子和一系列的2 d化合物(粘貼或進口自你最喜歡的繪圖包),FieldAlign將比較分子”欄位產生最好的3 d對齊為你的化
合物。
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Cresset-BMD FieldTemplater V2.0.1 (生物分子結構分析)
Cresset 公司的程式FieldTemplater為模型分析員或醫藥化學家工作,允許從二維結構中進行單獨的假定性產生生物活性構象的配體。
在三個或更多的活性分子情況下,FieldTemplater能夠解析的不僅是生物活性構象的分子,也包括相對一致的不同分子的結合
點。
MestREC.v4.9.9.9 1CD(提供資料處理、可視化和分析高解析度的核磁共振資料的功能)
MestRe-C 是一個軟體包,提供資料處理、可視化和分析高解析度的核磁共振資料的功能,圖形化使用者介面相當友好,在windows平台下功能
強大,適應性強。軟體還提供了大量的轉換工具,支援絕大部分核磁共振的資料格式,並且有著常規的處理、顯示和繪圖能力。
一維氫譜核磁圖譜處理軟體MestRES.v1.12 1CD
用MestRe-C軟體處理一維氫譜.pdf (145.39k)
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隨著傅立葉核磁譜儀的普及和儀器使用的開放,很多單位的核磁譜儀的使用幾乎達到飽和,因此有些單位為提高效率,規定譜儀只用於採樣
,不得處理資料和譜圖;也有時因滿足某種需要對譜圖或資料進行特定的處理,因此掌握一些核磁資料的處理技巧就很有必要了。
Calcusyn.v2.0 1CD(準確的分析聯合用藥作用,能夠自動量化現象如協同和抑製作用)
CalcuSyn是分析藥物複合互動作用,能夠自動量化各種現象如協同和抑製作用。混合藥物治療已成為常見的治療癌症,艾滋病等,CalcuSyn
是最廣泛使用的軟體建立在這一領域的有效性。
CalcuSyn可以很容易地與其它軟體整合,資料可以通過鍵盤輸入到工作表進入到分析引擎,同時處理個別藥品和固定比例或非固定比例組合
藥物。CalcuSyn自動組建圖表的資料和報告提供的統計摘要,對所有的藥物加上詳細的分析藥物相互作用,包括組合指數和EDX(x的任何值
)。預算的準確性和CI的能譜可以計算的蒙特卡羅類比或由高度準確的代數估計演算法。制定CalcuSyn包括劑量效應 median-effect,
isobolograms和CI -effect。
CalcuSyn有靈活的安排,印刷結果和圖表以試算表,文文書處理,圖形等全面的手冊提供PDF格式,並有詳細的輔助檔案。理論基礎的分析方
法,包括統計處理結果。已有數百個學術實驗室和製藥公司使用,CalcuSyn是不可少的藥物混合物的研究工具。
CLC.Genomics.Workbench.v3.6.5 1CD(綜合性基因分析系統)
CLC.Genomics.Workbench.v3.6.5.Linux 1CD
CLC 基因組平台是第一個綜合分析系統,它能快速分析和顯示新一代測序平台資料包括Illumina的Solexa, Roche 454的GS, ABI的SOLiD,
Helicos的HeliScope 。通過使用該平台,科學家可以輕鬆地使用自主研發的演算法來支援和擴充工作流程。其介面友好而直觀,操作簡便,易
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DHAL.ViewBox.v3.1.1.14 人頭測量分析
Dnastar.Lasergene.v7.1.Win2KXP 1CD(生物醫學軟體,用作DNA和蛋白質序列分析、重疊群拼接和基因工程管理)
Dnastar.Lasergene.v7.1.0.Proper 1CD
LaserGene是美國DNAStar公司發行的綜合性序列工具軟體,由於其在開始菜單中的名字是以公司名字命名所以現在幾乎約定俗成的稱之為
“DNAStar”,協助你發現和注釋DNA序列中的基因,並協助您操作生物學所關心的DNA的其他feature:包括ORFS、拼接點串連,轉錄因子結
合位點、重複序列、限制性內切酶酶切位點等,其功能幾乎囊括了分子生物學領域大多數內容。
現階段版本的LaserGene包括EditSeq、 MapDraw、SeqMan、GeneQuest、PrimerSelect、Megalign、Protean應用程式,具有序列的編輯、轉
換、開放閱讀框的尋找、引物設計、酶切作圖、序列比較等功能。
Elbow.Pro.III.v3.8.MacOSX 1CD(醫學解剖軟體)
由知名的 3D4Medical 公司出品,該公司出品的醫學軟體都十分的知名和優秀,如Essential Anatomy、Brain Pro等軟體,Elbow Pro 是肘
部參考工具,完全 3D 畫面,並且可360度旋轉,非常強大,醫學相關學習和工作者絕對值得收藏的一款工具!
Gastroplus v7.0-ISO 1CD(基於機制性生理模型的藥代動力學、藥效動力學(PBPK/PD)類比軟體)
該軟體是基於生理模型的藥代動力學、藥效動力學(PBPK/PD)類比軟體,可以類比藥物和其不同製劑經靜脈、口服、口腔、眼部、鼻腔和肺部
給藥後,在動物和人體內的藥代動力學和藥效動力學行為,協助DMPK和藥物製劑科學家們快速且有效地進行項目決策。
GastroPlus?在FDA和幾乎所有的全球頂尖製藥公司(TOP 19/20)中得到廣泛應用,被譽為同類軟體中的 “黃金標準”。GastroPlus?的模型曆
經Pfizer、Roche、Johnson & Johnson等頂尖製藥企業的驗證,在同類軟體中準確性排名第一。
目前Simulations Plus主要產品包括:ADMET Predictor、Medchem Studio、GastroPlus和DDDPlus。該系列產品得到業界高度推崇,全球
TOP50的製藥企業幾乎都是Simulations Plus的使用者,如Roche, Pfizer, GSK, Abbott, Novartis, Eli Lilly, Johnson & Johnson, Bayer,
Merck , Sanofi-Aventis等。
關於GastroPlus:
GastroPlus?為DMPK科學家提供的主要協助有:
?利用人體外資料和動物資料構建PBPK模型,進行種屬間外推,準確預測化合物在人體內的血漿和各個組織藥時曲線和PK參數(種屬間外推)
;
?PBPK建模以預測不同劑量下動物(小鼠、大鼠、犬和猴)的PK(藥時曲線和PK參數);
?類比不同人群(兒童、成人、老人等)中的藥代動力學行為;
?追蹤代謝產物的體內過程,預測母藥和代謝物在動物和人體各組織、血漿、尿液中的藥時曲線;
?建立PBPK-PD或PK-PD模型(線性或非線性PK均可),預測不同給藥途徑、劑量、劑型和給藥方案下,藥物在人體的藥效變化,優選候選化合物
、指導臨床給藥方案的設計和劑型選擇;
?類比或擬合複雜的非線性代謝和轉運過程,評估代謝酶和轉運體的貢獻;
?預測食物、年齡、性別、藥物聯用(DDI)、劑型、胃腸道pH、其它生理病理等因素變化下,藥物在人體的藥代動力學變化;
?類比眼部和肺部給藥後,藥物在眼部和肺部不同地區及體迴圈的藥時曲線。
GastroPlus?為製劑科學家提供的主要協助有:
?確定限制生物利用度的關鍵因素(溶解度、粒徑、劑量等),指導製劑研發;
?獨特的機制性體內外相關性(IVIVC)的建立,以豁免生物等效性實驗、制定溶出標準、指導製劑研發;
?虛擬生物等效性類比,在臨床實驗前預測受試製劑是否能夠通過生物等效性實驗,以指導決策;
?類比眼部和肺部給藥後,藥物在眼部和肺部不同地區及體迴圈的藥時曲線;
?類比不同緩控釋製劑在胃腸道各個地區的吸收、體內溶出和藥時曲線。
Hipax.Print.Manager.v3.2.1 1CD
InteLigand.LigandScout.v2.03.Linux 1CD藥物研究軟體
InteLigand.LigandScout.v2.03.MacOSX 1CD
LigandScout是一個藥物研究軟體工具,用三維的受體、底物 構建藥效團模型,結合虛擬篩選,是基於結構藥物設計必不可少的工具。
Life.Sciences.Clinical.Genomics.Assimilation.Module.v3.2 1CD(用於進行臨床醫學基因組研究的分析軟體。
Life.Sciences.Clinical.Genomics.HL7.CDA.Builder.v3.2 1CD 它們分別用於序列識別,特定基因構建等功能)
Life.Sciences.Clinical.Genomics.Universal.De-identification.Platform.v3.2 1CD
Materialise Simplant Pro v11.04 1CD(CT資料轉化3D映像工具)
Netter.Interactive.Atlas.Of.Human.Anatomy.v3.0-ISO 1CD(解剖互動軟體)
具備測驗功能,使用非常方便。軟體以“器官、位置、系統”分類,也具備強大的搜尋功能,介面中的所有詞條可以通過“Alt+點擊”來發
聲。
Tripos.Muse.v1.3 藥物設計軟體
Tripos公司新平台Pantheon下的第一個產品。“Pantheon”在希臘語中,意思是“萬神殿”,是供奉宇宙主要神祗的宮殿。在萬神殿中,你
會見到神奇的遠古眾神,傳說受到眾神祝福的人,將會得到無限的智慧和力量,被授予永遠的財富。Tripos公司即將推出 CADD領域的
“Pantheon”,它集多年的科研實力與最新技術於一體,在藥物設計和 分子 類比 領域打造一個全新的“萬神殿”。在“Pantheon”平台上
,會陸續引入各種藥物設計方法,2009年1月,“萬神殿”裡第一位向我們走來是MUSE(繆斯)女神,她通常是一篇史詩或故事開啟的象徵。
MUSE是為加快先導候選藥物識別與最佳化而設計的一個成熟的全新藥物設計工作流程。利用MUSE,CADD科研工作者以及藥物 化學 工作者可以
進行滿足特定設計指標的全新 結構 、骨架、或側鏈的識別。適用於先導化合物的替換、骨架替換或在固定母核周圍產生新的R-基團,產生
滿足多重設計指標的新穎類藥化合物。
Materialise Simplant Pro v11.04 1CD(CT資料轉化3D映像工具)
Merge.eFilm.Workstation.v2.1.2+使用者手冊 1CD(在醫學影像處理領域排在首位的診斷和處理工具。它可以同時
檢查多個映像,進行相互參考,測量,旋轉,縮放和注釋)
MestREC.v4.9.9.9 1CD(提供資料處理、可視化和分析高解析度的核磁共振資料的功能)
MestRES.v1.12 1CD
Molecular.Operating.Environment.v2008.10-ISO 1DVD(藥物研發)
Netter.Interactive.Atlas.Of.Human.Anatomy.v3.0-ISO 1CD(解剖互動軟體)
Orthocrat.TraumaCAD.v2.0-ISO 1CD(外科手術CAD)
Vector.NTI.Advance.v10.0 1CD(綜合性蛋白核酸分析工具包)
Vitrea 2 v3.7 for Win95_98_NT-ISO 1CD(心臟功能分析)
Sante.DICOM.Editor.v1.0.21 1CD(DICOM編輯器,醫學用軟體,可以查看,處理以及編輯任何形態的DICOM映像的工具)
Sante.DICOM.Viewer.Pro.v1.0.21 1CD(DICOM查看器,醫學用軟體,可以查看DICOM映像的工具)
Schrodinger.Suite.2007-ISO 1CD(解決藥物研究中挑戰的完整軟體套裝)
Tripos.Sybyl.v7.3.Unix-ISO 4CD+1DVD
Tripos.Sybyl.v8.0.SP6.Update.Only.Linux & Irix 1CD
Tripos.Sybyl.v8.0.Linux & Irix-ISO 1CD+2DVD(SYBYL軟體包,Tripos出品的專業分子類比平台,涵蓋了分子類比與顯示、定量構效
關係和ADME、藥效團模型、生物資訊學、基於結構的藥物設計、化學資訊學和資料庫、
組合化學和分子多樣性、NMR資料處理、化合物實體提供等多種與藥物研究和開發相關的
方向,為使用者提供全面的藥物設計和生物化學研究的解決方案)
eVision v6.0-ISO 1CD(工業、醫學的影像計算比對分析軟體,EasyAccess好用)
Simpleware.ScanIP.ScanFE.ScanCAD.v3.1 口腔醫學分析
Materialise.Mimics.Innovation.Suite.v17.0.Medical.&.Research.Win32_64 4CD比利時醫學軟體
Schrodinger.Suites.2015-2.Win32_64-Linux64 MacOSX(解決藥物研究中挑戰的完整軟體套裝)
Schrodinger.KNIME.Workflows.2015-2藥物設計軟體
Molegro Virtual Docker v4.0.2 1CD電腦輔助藥物設計軟體
BioSolveIT.LeadIT.v1.1.0 1CD(功能強大的FBLD/SBDD藥物設計平台)
Tripos.Muse.v1.0.1 藥物設計軟體
MiPACS Dental Enterprise Solution v3.1 (醫學牙科軟體)
Delcam DentCAD 2015 Win32_64 1DVD3D牙科專業CAD設計軟體
Delcam Dental v2010 SP2-ISO 1CD(專業牙科軟體)
DElcam DentMill 5070 牙科加工解決方案
Delcam DentCAD 8112 SP2 牙科設計軟體
MiPACS Dental Enterprise Solution v3.1 (醫學牙科軟體)
Szybki.v1.2 1CD(化學分子結構和蛋白質結構最佳化工具)
Tripos.Benchware.3D.Explorer.v2.7 1CD(分子結構檢視)
Benchware 3D Explorer
專門設計用來實現把三維化學結構在研究工作流程中進行互動操作,並從中擷取資訊。這意味著任何生命科學研究工作者可以利用Benchware
3D Explorer 來輔助工作,通過案頭PC系統來實現3D分子結構可視化,以獲得更多決策資訊。
Benchware 3D
Explorer使研究人員能夠更方便的共用和瞭解複雜分子資料,如蛋白質配體晶體結構,對接成果,分子結構序列,以及其它的三維化學結構
資訊。
Benchware 3D Explorer獨特的綜合效能協助研究人員更好的組織研發和應用,對他們的研究決策過程提供積極的協助。
Molsoft ICM-Pro v3.5-0a (3D微觀立體結構):
觀看和編輯生物分子3D微觀立體結構的軟體。互動式分子2D-3D結構轉換和可視化工具。
ICM 彈性銜接技術的重點在於可比目前研究者使用實驗的方式篩選更多、花費更少的時間和金錢。可從數百萬個化學成分中監別出幾百個有
價值的化合物,基本上,篩選的時間縮短則可以有時間篩選更多。ICM也可以檢視每一個化合物對一系列的接受器的反應,Abagyan補充說明
表示:一個化合物只與一個接受器有作用是相當少見的,例如:就乳癌而言,就有很多接受器可以與HER2抑制物反應,這對於預測互動作用
與從一開始就能設計出具選擇性的化合物而言相當重要。
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Molegro.Data.Modeller.2009.v2.1.0 1CD醫學資料分析
Molegro 高度互動式使用者介面對於快速和直覺資料的採集是個理想的選擇,與基於解決方案或命令驅動式的統計產品的複雜工作流程形成了
對照。
Molegro Virtual Docker v4.2.0 1CD電腦輔助藥物設計軟體
Molegro Vitual Docker --電腦輔助藥物設計軟體。是跨平台(Windows/MacOSX/Linux)的預測蛋白質跟化學小分子結合的軟體,軟體提供
在Docking過程中所需的所有功能,從分子結構的preparation到binding site的預測以及最後的小分子的結合未知及構造 (conformation)。
軟體本身由最新的演算法,可以提供高準確性的docking結果,以及簡單好用的視窗介面操作。
Molegro Virtual Docking提供:
1、高準確性的docking結果,與其他docking軟體想比較之下,為準確率最好的(MVD: 87%, Glide: 82%, Surflex: 75%, FlexX: 58%)
2、簡單易用的軟體介面:提供互動步驟方法 (wizard),讓使用者可以很快的設定及執行docking,也針對docking結果提供完整的視覺
及分析工具。
3、跨平台的整合:Molegro Virtual Docker 提供在Linux, Windows,及Mac平台的版本以及其結果可以在各平台存取
軟體提供Docking的互動步驟來進行Docking的計算,在互動模式中,可以提供:
選擇哪些分子要進行Docking計算;
選擇哪個鍵結地區來進行Docking計算(MVD)會先自動計算出有可能的binding pockets
設定演算法及計算過程的參數設定
管理及增加額外的限制條件
在計算的過程中檢查計算過程中的錯誤狀況
其他特徵:
a. 可以在Mac (PowerPC及Intel), Linux (32-bit及64-bit), 及 Windows的平台執行
b. 提供巨集的功能
c. 提供客制化的分子表面及骨乾的表示
d. Biomolecule generator可以轉換PDB檔案給軟體來用
e. 提供文字標示分子的特性
f. 提供線上協助及檢查新版更新
g. 提供使用MVD本身的scripting language及其他程式語言(Python已經包含)
h. Pose Modifier可以提供使用者修改化學分子的結構
Vector NTI Advance 10.3 1CD(生物科學工程)
Vector NTI Suite是一套功能強大、介面美觀而又友好的分子生物學應用軟體包。它主要包括四個組件,分別對DNA、RNA和蛋白質進行各種
分析和操作。
Visage.Imaging.Amira.v5.4.3.Win32_64 2CD(生物工程資料視覺化工具)
Amira能夠識別生命科學和生物醫學的資料的來源以及類型、方式,這些類型包括:光學和電子顯微鏡、CT,MR,PET,SPECT,超聲波、工程
和表面建模工具、蛋白資料庫和分子類比,以及各種物理測量和類比。當多維資料需要加以可視化並進行探索的時候,Amira提供了一個極其
豐富的一套功能強大的工具與一個直觀和便於使用的圖形化使用者介面。
Amira軟體中所提供的先進的可視化技術,讓你對資料獲得詳細的瞭解。自動和互動式分割和建模工具,支援靈活創造的三維表面和有限元模
型為最優的可視化和類比。現代圖形硬體被有效利用來顯示大型資料集,在互動速度與映像品質方面都無與倫比。
Amira的三維渲染功能強大,無論是用於三維資料研究還是示範都能獲得優秀的效果。
Cytel.East.v5.0 1CD(醫學臨床實驗設計系統)