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處理醫學映像的一個難題在於 座標系的不一致。
1. 全局座標系; 2. 解剖學座標系(病人座標系); 3. 映像座標系 這些座標系以不同的方式呈現它們的資料;
2. 解剖學座標系(病人座標系)
(1) 橫斷面(The axial plane): 與地面是平行的那個面。將人分成上身(superior)和下身(inferior)兩個部分;
(2) 冠狀面(The coronal plane): 與地面垂直,將人體分割前後(Anterior and Posterior)兩個部分;
(3) 矢狀面(The sagittal plane): 與地面垂直,將人體分割成左右(left and right)兩個部分;
在這個空間中,映像被採樣;
這六個方向,那個為正方向,哪個為負方向???
#1: LPS為正(用於Dicom映像與itk工具包;)
#2: RAS為正(正好在LPS對面, 用於3D Slice軟體)
這兩種座標沒有什麼根本區別,在處理時候,需要知道映像引用了哪種座標系;
3. 映像座標系
醫學掃描器器 建立了規則的點和網格的矩陣數組,它的原點在左上方;除了每個體素的強度值,映像在解剖學座標系裡面的原點以及間距也被儲存了下來;
這個原點代表映像第一個體素voxel(0,0,0)在解剖學座標系中的位置,如(100mm, 50mm, -25mm);
這個間距指定體素的採樣點在解剖學座標系中的實際間距; 例如(1.5mm(spacing[0]), 0.5mm(spacing[1]), 0.5mm(spacing[2]))
如果知道了原點和間距,便可以計算每個體素在解剖學座標系中的對應位置;(通過仿射變換)
映像座標上的原點對應解剖學座標(50, 300), LS上的映像; 間距是(50mm,50mm)
為什麼要在最後面加個1, 這是因為映像座標原點從(0,0)開始的;沒有末尾那個1的話,對原點求對應座標時候,會得到0;
Medical Image Process_醫學映像座標系