非root許可權安裝python+HTSeq+numpy+easy_install__python

1.直接非root許可權安裝一個python

首先在軟體列表檔案夾下 

mkdir python-2.7

cd python-2.7

下載python-2.7.10 傳至當前檔案夾

cd python-2.7.10

[plain]  view plain  copy ./configure --prefix=/lustre/user/zhangjia/software/python-2.7  
[plain]  view plain  copy make   make install   然後就會在python-2.7這個檔案下面組建目錄bin

修改.bashrc檔案

添加:

[plain]  view plain  copy PYTHONDIR=/lustre/user/zhangjia/software/python-2.7/bin   export PATH=$PYTHONDIR:$PATH   執行.bashrc  

source  和 .  是一樣的

安裝成功，現在python是自己的。

2.安裝easy_install

下載ez_setup.py

然後python ez_setup.py build

提示https://pypi.python.org/packages/source/s/setuptools/setuptools-8.0.4.zip這個setuptools沒下到，不知道是不是超算連網的原因。直接開啟這個網頁，下載好setuptools-8.0.4.zip 沒解壓放到python-2.7檔案夾下面。

重新執行 python ez_setup.py build

OK!

python ez_setup.py install

安裝在自己的python下面。出現了easy_install

然而，試了下 

easy_install numpy  並沒有成功，easy_install放著不動。

3.安裝pip

下載pip

解壓pip包

安裝： python setuppy install

安裝完後，可在python2.7/bin下找到pip

4.安裝numpy [plain]  view plain  copy pip install numpy  

5.安裝HTSeq [plain]  view plain  copy pip install HTSeq 

python-2.7/bin下出現了htseq-count 和 htseq-qa