Pthon批量處理將pdb檔案產生dssp檔案

# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on Sat Jun 20 19:36:34 2015@author: chaofn"""import os"""這個程式的目的是將linux下/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb目錄中的所有檔案（一共有215個檔案）批處理將pdb檔案產生dssp檔案"""#listdir返迴文件名的列表fileLine=os.listdir('/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb')#遍曆整個列表for i in range(len(fileLine)-1):  #將字串用變數表示  input_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb/'+fileLine[i]  #先去掉檔案名稱的尾碼，然後形成尾碼為dssp的檔案名稱  out_file=fileLine[i].split('.')[0]+'.dssp'  output_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_dssp/'+out_file  #注意：參數的傳遞（先是%s，然後是%變數名），多個變數的傳入要用元組表示，在元組前用%  os.system('/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s' %(input_file,output_file))

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