R與java整合

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Java調用r主要有三種方式，rJava，rServer還有rCaller，這邊主要講用rJava調用

rJava是一個R語言和Java語言的通訊介面，通過底層JNI實現調用，允許在R中直接調用Java的對象和方法。由於rJava是底層介面，並使用JNI作為介面調用，所以效率非常高。在JRI的方案中，JVM直接通過記憶體直接載入RVM，調用流程績效幾乎無損耗，因此是非常高效串連通道，是R和Java通訊的首選開發包。

之前用R3.0.2，不知道是否是版本太高的原因，

利用rjava實現java調用R的過程中，像列印變數，這些都可以成功
String version = re.eval("R.version.string").asString();System.out.println(version);
定義變數的情況也可以
REXP x=re.eval("1:10");
System.out.println("REXP result = "+x);
re.eval("print(1:10/3)");

但是涉及到調用基本函數的時候，卻是總報null 指標的錯誤。
比如
re.eval("rnorm(10)");
double[] arr =re.eval("rnorm(10)").asDoubleArray();

或者是內建的測試代碼中的
REXP x;
re.eval("data(iris)",false);
System.out.println(x=re.eval("iris"));

 

進入正題，首先開啟R軟體，

install.packages("rJava")

如果library(rJava)不報錯，說明第一步成功了。

啟動jvm

.jinit()

s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!")

s

[1] "Java-Object{Hello World!}"

 

然後設定環境變數
CLASSPATH=D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri;
PATH=D:\proSoftware\R-2.15.0\bin\i386
R_HOME=D:\proSoftware\R-2.15.0\R-2.15.0\

 

將D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri下的三個jar包（JRIEngine.jar，JRI.jar，REngine.jar）拷到C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_10\lib目錄下，即jdk目錄的lib下

開啟eclipse，建立Java project。同時將上述三個包匯入工程中。

D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri\examples目錄下有兩個內建測試代碼rtest.java和rtest2.java。

運行這兩個代碼，如果結果不報錯，說明調用成功。

運行之前記得run configurations中添加VM參數設定為 -Djava.library.path=D:\proSoftware\R-2.15.0\library\rJava\jri

 

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