生信學習-二代測序知乎專欄總結[轉]

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轉自：https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684

1.基本概念

• flowcell 是指Illumina測序時，測序反應發生的位置，1個flowcell含有8條lane
• lane 每一個flowcell上都有8條泳道，用於測序反應，可以添加試劑，洗脫等等
• tile 每一次測序熒光掃描的最小單位
• reads 指測序的結果，1條序列一般稱為1條reads
• bp base pair 堿基對，用于衡量序列長度
• 雙端測序 只一條序列可能比較長如500bp，我們可以兩端每端各測150bp
• junction 上面說的雙端測序，中間會留有200bp測不到的東西，我們叫junction
• adapter 就是測序中需要的一段特定的序列，有類似於引物的功能
• primer PCR中的引物

cDNA：complementary DNA互補脫氧核糖核酸。以一種逆轉錄酶，以mRNA為模板做成的複製品，將真核生物的基因(以mRNA的形式)複製到原核生物細胞中。

似乎看懂了，明天總結一下，並且看一下pdf!!!

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