kaggle資料採礦——以Titanic為例介紹處理資料大致步驟,kaggletitanic
Titanic是kaggle上的一道just for fun的題,沒有獎金,但是資料整潔,拿來練手最好不過。
本文以 Titanic 的資料,使用較為簡單的決策樹,介紹處理資料大致過程、步驟
注意,本文的目的,在於協助你入門資料採礦,熟悉處理資料步驟、流程
決策樹模型是一種簡單易用的非參數分類器。它不需要對資料有任何的先驗假設,計算速度較快,結果容易解釋,而且穩健性強,對雜訊資料和缺失資料不敏感。下面示範用kaggle競賽titanic中的資料集為做決策樹分類,目標變數為survive
讀取資料
import numpy as npimport pandas as pddf = pd.read_csv('train.csv', header=0)
資料整理
- 只取出三個自變數
- 將Age(年齡)缺失的資料補全
- 將Pclass變數轉變為三個 Summy 變數
- 將sex轉為0-1變數
subdf = df[['Pclass','Sex','Age']]y = df.Survived# sklearn中的Imputer也可以age = subdf['Age'].fillna(value=subdf.Age.mean())# sklearn OneHotEncoder也可以pclass = pd.get_dummies(subdf['Pclass'],prefix='Pclass')sex = (subdf['Sex']=='male').astype('int')X = pd.concat([pclass,age,sex],axis=1)X.head()
輸出結果
建立模型
from sklearn.cross_validation import train_test_splitX_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.25, random_state=33)
from sklearn import treeclf = tree.DecisionTreeClassifier(criterion='entropy', max_depth=3,min_samples_leaf=5)clf = clf.fit(X_train,y_train)print("準確率為:{:.2f}".format(clf.score(X_test,y_test)))
輸出結果如下
準確率為:0.83
clf.feature_importances_
輸出如下
array([ 0.08398076, 0. , 0.23320717, 0.10534824, 0.57746383])
import matplotlib.pyplot as pltfeature_importance = clf.feature_importances_important_features = X_train.columns.values[0::]feature_importance = 100.0 * (feature_importance / feature_importance.max())sorted_idx = np.argsort(feature_importance)[::-1]pos = np.arange(sorted_idx.shape[0]) + .5plt.title('Feature Importance')plt.barh(pos, feature_importance[sorted_idx[::-1]], color='r',align='center')plt.yticks(pos, important_features)plt.xlabel('Relative Importance')plt.draw()plt.show()
對於隨機森林如何得到變數的重要性,可以看scikit-learn官方文檔
當然在得到重要的特徵後,我們就可以把不重要的特徵去掉了,以提高模型的訓練速度
最後是
from sklearn import cross_validationscores1 = cross_validation.cross_val_score(clf, X, y, cv=10)scores1
輸出結果如下:
array([ 0.82222222, 0.82222222, 0.7752809 , 0.87640449, 0.82022472, 0.76404494, 0.7752809 , 0.76404494, 0.83146067, 0.78409091])
from sklearn import metricsdef measure_performance(X,y,clf, show_accuracy=True, show_classification_report=True, show_confusion_matrix=True): y_pred=clf.predict(X) if show_accuracy: print("Accuracy:{0:.3f}".format(metrics.accuracy_score(y,y_pred)),"\n") if show_classification_report: print("Classification report") print(metrics.classification_report(y,y_pred),"\n") if show_confusion_matrix: print("Confusion matrix") print(metrics.confusion_matrix(y,y_pred),"\n")measure_performance(X_test,y_test,clf, show_classification_report=True, show_confusion_matrix=True)
輸出結果如下,可以看到 precision(精確度)recall(召回率)等更多特徵
Accuracy:0.834 Classification report precision recall f1-score support 0 0.85 0.88 0.86 134 1 0.81 0.76 0.79 89avg / total 0.83 0.83 0.83 223Confusion matrix[[118 16] [ 21 68]]
與隨機森林進行比較
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifierclf2 = RandomForestClassifier(n_estimators=1000,random_state=33)clf2 = clf2.fit(X_train,y_train)scores2 = cross_validation.cross_val_score(clf2,X, y, cv=10)clf2.feature_importances_scores2.mean(), scores1.mean()
準確率輸出(這裡用的是10折交叉驗證後的平均值)
(0.81262938372488946, 0.80352769265690616)
可以看到隨機森林的準確要比決策樹高0.1左右
總結
經過上面介紹分析,我們走過了一個資料科學家在拿到資料到得出結論的所有步驟
這篇文章重要的不是結果,而是協助你瞭解處理資料大致過程、步驟
剩下的細節,就是你發揮自己的想象力,進行改進、創新了
參考連結
python的決策樹和隨機森林
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